29 Nisan'da Kırgız-Tacik sınırında silahlı çatışmanın yaşandığı Batken bölgesinin Batken İlçesindeki Tört-Köçö, Çır-Döbö köylerine Tacik tarafı Mi-24 helikopteriyle havadan ateş etmiştir. Bu, Kırgız Cumhuriyeti Ulusal Güvenlik Devlet Komitesi Sınır Servisi Halkla İlişkiler ve Medya Departmanı tarafından bildirildi.

Verdikleri bilgilere göre Tacik askerler ayrıca Kırgız sınır karakollarına da ateş açmıştır. Kırgız Cumhuriyeti sınır servisi, sınırdaki çatışmanın Tacik tarafı tarafından kışkırtıldığını belirtmiştir.

28 Nisan'da, Batken bölgesinin Kök-Taş köyü yakınlarında,Golovnoy su dağıtım merkezi'nde, Kırgız-Tacik  sınır köylerinin sakinleri arasında bir olay meydana gelmişti.

29 Nisan'da sınırdaki durum tırmanmıştı ve iki ülke ordusu arasında neredeyse gece yarısına kadar süren bir çatışmaya yol açmıştı. Kırgızistan Devlet Ulusal Güvenlik Komitesi Sınır Servisi'ne göre, saat 23.45'te itfaiye durdurulmuştu. 29 Nisan gecesi taraflar, tam bir ateşkes, personel ve askeri teçhizatın kalıcı olarak konuşlandırıldıkları yerlere geri çekilmesinin yanı sıra gerginliğin tırmanmasını önlemek için tedbirlerin alınması konusunda ortak bir bildiri yayınlamıştır. Ancak ateşkes anlaşmasına rağmen Tacikistan askerleri ve Tacik vatandaşları 30 Nisan sabahına kadar Kırgız köylerini ve sivilleri hedefe almıştır. 

Kırgızistan Sağlık ve Sosyal Kalkınma Bakanlığı'na göre 30 Nisan sabahı Kırgız Cumhuriyeti'nin yaralı sayısı 134'e ulaşmış ve 13 kişi hayatını kaybetmiştir. Hayatını  kaybedenlerin arasında 12 yaştaki bir çocuk ve 3 Kırgız askeri olduğu söylenmektedir. Tacik medyası, Tacik tarafından 90 yaralı ve yaklaşık 10 ölü hakkında haber vermektedir, ancak bilgilerin henüz resmi bir teyidi yoktur.