АУЦА – один из лучших вузов региона и первый университет в Центральной Азии, выпускники которого получают помимо диплома кыргызского государственного образца, еще и диплом, аккредитованный в США. Это стало возможно благодаря партнёрскому соглашению с Bard College.

Американский университет в Центральной Азии сотрудничает с ведущими университетами и организациями во всем мире и ведет активную научно-исследовательскую деятельность. Университет проводит и сам участвует в различных конференциях и семинарах. Для продвижения научной работы в АУЦА создан офис по исследованиям. Ежегодно на конкурсной основе в АУЦА финансируются исследования в самых различных областях: энергетика, безопасность, развитие бизнеса, инвестиции, демократическое развитие и вопросы верховенства права. В них принимают участие не только преподаватели университета, но и студенты. АУЦА развивает исследовательские способности и общее мировоззрение своих учащихся, ведь обучение, основанное на научных исследованиях, готовит студентов к эффективному решению различных задач и достижению поставленных целей.